Herzogkasten

Im Innenhof des Museums ist ein originales Teilstück sowie die Rekonstruktion der Befestigungsmauer des keltischen Oppidums Alkimoennis zu besichtigen. Diese aufwändig befestigte Stadt befand zog sich von der Altstadt Kelheims im Zwickel von Donau und Altmühl über den Michels- und Hirschberg  bis auf die Höhe von Kloster Weltenburg. Die Mauern, heute meist noch gut als Erdwälle erkennbar, umzogen das ca. 600 ha große Gelände und hatten eine Gesamtlänge von rund 10 km.

Daneben sind Nachbauten von zwei bronzezeitlichen Grabhügeln und eine Kopie einer Statue des römischen Kriegsgottes Mars sowie zeitgenössische Bildhauerarbeiten zu sehen. 

Im Innenhof befindet sich die erste Station des Archäologieparks Altmühltal. Der längste Archäologiepark Europas präsentiert auf fast 40 km Länge Rekonstruktionen und Visualisierungen von archäologische Fundstätten entlang des Main-Donau-Kanals. Viele der originalen Fundstücke aus den Ausgrabungen am Main-Donau-Kanal sind im Museum zu besichtigen.